APS-microstroomtherapie is één van de veiligste manieren van behandelen. Desondanks zijn er toch enkele situaties waarin APS niet toegepast mag worden.

Personen die lijden aan epilepsie 
Personen met een pacemaker 
Personen die een acute trombose of infarct hebben gehad (tot 12 weken erna)
Vrouwen die zwanger zijn
Kinderen beneden de leeftijd waarop zij kunnen aangeven wat zij voelen
Personen die lijden aan kanker

APS kan veilig gebruikt worden door patiënten met knie- en/of heupprothesen of andere prothesen of metalen implantaten.